Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD7Q9P2D1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHD7Q9P2D1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms