Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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