Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PNPLA3Q9NST1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.6 ms