Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN4Q9NQC3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms