Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASS4Q9NQ75 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms