Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM15Q9C019 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM15Q9C019 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM15Q9C019 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms