Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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