Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF4Q9BQW3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EBF4Q9BQW3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms