Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GORASP1Q9BQQ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms