Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MYD88Q99836 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms