Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms