Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PFDN5Q99471 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms