Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SENP8Q96LD8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SENP8Q96LD8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms