Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35A4Q96G79 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms