Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GCC1Q96CN9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GCC1Q96CN9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GCC1Q96CN9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms