Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP6V1E2Q96A05 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms