Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms