Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms