Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD53Q8N9V6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms