Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPUSD2Q8IZ73 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPUSD2Q8IZ73 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPUSD2Q8IZ73 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPUSD2Q8IZ73 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RPUSD2Q8IZ73 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPUSD2Q8IZ73 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPUSD2Q8IZ73 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPUSD2Q8IZ73 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPUSD2Q8IZ73 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPUSD2Q8IZ73 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPUSD2Q8IZ73 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPUSD2Q8IZ73 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPUSD2Q8IZ73 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPUSD2Q8IZ73 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPUSD2Q8IZ73 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPUSD2Q8IZ73 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPUSD2Q8IZ73 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPUSD2Q8IZ73 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPUSD2Q8IZ73 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180 ms