Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM139Q8IV31 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms