Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1989.9 ms