Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
STRCQ7RTU9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
STRCQ7RTU9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms