Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHLHA9Q7RTU4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BHLHA9Q7RTU4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms