Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI25

CNIH2, Protein cornichon homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH2Q6PI25 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNIH2Q6PI25 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNIH2Q6PI25 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNIH2Q6PI25 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNIH2Q6PI25 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNIH2Q6PI25 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNIH2Q6PI25 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNIH2Q6PI25 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNIH2Q6PI25 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNIH2Q6PI25 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNIH2Q6PI25 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNIH2Q6PI25 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms