Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED27Q6P2C8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms