Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFCAB12Q6NXP0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
EFCAB12Q6NXP0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms