Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms