Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COBLL1Q53SF7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms