Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMT12Q53H54 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT12Q53H54 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms