Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRFIP1Q32MZ4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRFIP1Q32MZ4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms