Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXT1Q16394 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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EXT1Q16394 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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EXT1Q16394 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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EXT1Q16394 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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EXT1Q16394 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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EXT1Q16394 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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EXT1Q16394 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
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EXT1Q16394 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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EXT1Q16394 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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