Protein–RNA interactions for Protein: Q15031

LARS2, Probable leucine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 903 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARS2Q15031 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LARS2Q15031 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LARS2Q15031 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.8 ms