Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSHL1Q14406 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSHL1Q14406 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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