Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF9Q13886 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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