Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM32Q13049 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM32Q13049 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM32Q13049 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM32Q13049 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM32Q13049 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM32Q13049 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM32Q13049 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM32Q13049 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM32Q13049 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM32Q13049 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM32Q13049 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM32Q13049 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM32Q13049 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM32Q13049 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM32Q13049 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM32Q13049 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM32Q13049 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM32Q13049 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM32Q13049 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM32Q13049 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM32Q13049 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM32Q13049 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
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