Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HSPB3Q12988 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms