Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPRL3Q12980 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPRL3Q12980 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPRL3Q12980 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPRL3Q12980 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPRL3Q12980 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPRL3Q12980 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPRL3Q12980 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPRL3Q12980 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPRL3Q12980 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NPRL3Q12980 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPRL3Q12980 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPRL3Q12980 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPRL3Q12980 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPRL3Q12980 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NPRL3Q12980 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPRL3Q12980 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPRL3Q12980 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPRL3Q12980 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPRL3Q12980 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NPRL3Q12980 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NPRL3Q12980 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPRL3Q12980 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPRL3Q12980 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPRL3Q12980 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPRL3Q12980 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPRL3Q12980 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPRL3Q12980 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPRL3Q12980 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPRL3Q12980 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPRL3Q12980 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPRL3Q12980 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPRL3Q12980 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPRL3Q12980 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPRL3Q12980 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPRL3Q12980 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPRL3Q12980 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPRL3Q12980 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPRL3Q12980 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPRL3Q12980 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NPRL3Q12980 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPRL3Q12980 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPRL3Q12980 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPRL3Q12980 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPRL3Q12980 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPRL3Q12980 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPRL3Q12980 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPRL3Q12980 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPRL3Q12980 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPRL3Q12980 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NPRL3Q12980 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NPRL3Q12980 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPRL3Q12980 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPRL3Q12980 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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