Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNA1Q09470 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms