Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAE1P78406 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAE1P78406 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAE1P78406 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAE1P78406 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAE1P78406 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAE1P78406 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAE1P78406 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAE1P78406 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAE1P78406 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAE1P78406 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAE1P78406 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAE1P78406 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAE1P78406 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAE1P78406 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAE1P78406 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAE1P78406 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAE1P78406 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAE1P78406 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAE1P78406 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAE1P78406 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAE1P78406 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAE1P78406 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAE1P78406 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAE1P78406 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAE1P78406 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAE1P78406 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAE1P78406 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAE1P78406 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAE1P78406 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAE1P78406 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAE1P78406 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAE1P78406 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAE1P78406 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAE1P78406 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAE1P78406 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAE1P78406 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAE1P78406 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAE1P78406 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAE1P78406 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAE1P78406 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAE1P78406 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAE1P78406 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAE1P78406 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAE1P78406 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAE1P78406 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAE1P78406 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAE1P78406 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAE1P78406 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAE1P78406 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAE1P78406 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAE1P78406 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAE1P78406 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAE1P78406 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAE1P78406 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAE1P78406 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAE1P78406 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAE1P78406 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAE1P78406 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAE1P78406 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAE1P78406 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAE1P78406 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAE1P78406 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAE1P78406 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAE1P78406 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAE1P78406 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAE1P78406 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAE1P78406 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAE1P78406 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAE1P78406 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAE1P78406 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAE1P78406 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAE1P78406 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAE1P78406 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAE1P78406 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAE1P78406 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAE1P78406 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAE1P78406 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAE1P78406 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAE1P78406 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAE1P78406 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAE1P78406 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAE1P78406 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAE1P78406 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAE1P78406 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAE1P78406 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAE1P78406 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAE1P78406 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAE1P78406 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAE1P78406 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAE1P78406 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAE1P78406 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAE1P78406 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAE1P78406 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAE1P78406 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAE1P78406 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAE1P78406 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAE1P78406 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAE1P78406 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAE1P78406 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms