Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 494.5 ms