Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP107P57740 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP107P57740 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP107P57740 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP107P57740 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP107P57740 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP107P57740 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP107P57740 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP107P57740 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP107P57740 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP107P57740 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP107P57740 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP107P57740 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP107P57740 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP107P57740 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP107P57740 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP107P57740 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP107P57740 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP107P57740 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP107P57740 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP107P57740 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP107P57740 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP107P57740 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP107P57740 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP107P57740 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP107P57740 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP107P57740 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP107P57740 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP107P57740 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP107P57740 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP107P57740 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP107P57740 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP107P57740 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP107P57740 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP107P57740 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP107P57740 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP107P57740 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP107P57740 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP107P57740 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP107P57740 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP107P57740 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP107P57740 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP107P57740 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP107P57740 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP107P57740 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP107P57740 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP107P57740 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP107P57740 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP107P57740 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP107P57740 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP107P57740 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP107P57740 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP107P57740 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP107P57740 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP107P57740 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP107P57740 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP107P57740 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP107P57740 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP107P57740 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP107P57740 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP107P57740 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP107P57740 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP107P57740 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP107P57740 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP107P57740 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP107P57740 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP107P57740 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP107P57740 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP107P57740 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP107P57740 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP107P57740 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP107P57740 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP107P57740 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP107P57740 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP107P57740 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP107P57740 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP107P57740 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP107P57740 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP107P57740 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP107P57740 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP107P57740 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP107P57740 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP107P57740 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP107P57740 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP107P57740 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP107P57740 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP107P57740 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP107P57740 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP107P57740 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP107P57740 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP107P57740 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP107P57740 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP107P57740 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP107P57740 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP107P57740 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP107P57740 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP107P57740 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP107P57740 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP107P57740 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP107P57740 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms