Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MTTPP55157 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MTTPP55157 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTTPP55157 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTTPP55157 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTTPP55157 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTTPP55157 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTTPP55157 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTTPP55157 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTTPP55157 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MTTPP55157 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTTPP55157 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTTPP55157 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTTPP55157 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTTPP55157 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTTPP55157 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTTPP55157 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTTPP55157 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTTPP55157 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTTPP55157 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTTPP55157 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTTPP55157 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MTTPP55157 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTTPP55157 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTTPP55157 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTTPP55157 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTTPP55157 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTTPP55157 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTTPP55157 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTTPP55157 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MTTPP55157 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTTPP55157 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTTPP55157 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTTPP55157 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTTPP55157 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTTPP55157 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTTPP55157 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTTPP55157 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTTPP55157 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTTPP55157 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTTPP55157 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTTPP55157 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MTTPP55157 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTTPP55157 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTTPP55157 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTTPP55157 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTTPP55157 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTTPP55157 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTTPP55157 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTTPP55157 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTTPP55157 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTTPP55157 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTTPP55157 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTTPP55157 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTTPP55157 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTTPP55157 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTTPP55157 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTTPP55157 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTTPP55157 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTTPP55157 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTTPP55157 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTTPP55157 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTTPP55157 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTTPP55157 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTTPP55157 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTTPP55157 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTTPP55157 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTTPP55157 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTTPP55157 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTTPP55157 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTTPP55157 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTTPP55157 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTTPP55157 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTTPP55157 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTTPP55157 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTTPP55157 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MTTPP55157 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MTTPP55157 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTTPP55157 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTTPP55157 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTTPP55157 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTTPP55157 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MTTPP55157 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTTPP55157 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTTPP55157 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTTPP55157 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTTPP55157 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTTPP55157 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTTPP55157 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTTPP55157 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTTPP55157 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTTPP55157 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTTPP55157 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTTPP55157 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTTPP55157 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTTPP55157 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTTPP55157 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTTPP55157 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTTPP55157 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTTPP55157 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms