Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC18A1P54219 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms