Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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PGGT1BP53609 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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PGGT1BP53609 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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PGGT1BP53609 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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PGGT1BP53609 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGGT1BP53609 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
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PGGT1BP53609 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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