Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA2P52292 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA2P52292 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA2P52292 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA2P52292 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA2P52292 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA2P52292 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA2P52292 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA2P52292 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA2P52292 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA2P52292 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA2P52292 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA2P52292 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA2P52292 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA2P52292 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms