Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCN3P51790 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCN3P51790 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCN3P51790 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCN3P51790 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCN3P51790 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCN3P51790 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN3P51790 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLCN3P51790 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms