Protein–RNA interactions for Protein: P40426

PBX3, Pre-B-cell leukemia transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX3P40426 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX3P40426 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX3P40426 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX3P40426 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX3P40426 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX3P40426 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX3P40426 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX3P40426 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX3P40426 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX3P40426 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX3P40426 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX3P40426 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX3P40426 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX3P40426 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX3P40426 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX3P40426 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX3P40426 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX3P40426 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX3P40426 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX3P40426 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX3P40426 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX3P40426 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX3P40426 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX3P40426 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX3P40426 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX3P40426 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX3P40426 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX3P40426 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX3P40426 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX3P40426 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBX3P40426 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBX3P40426 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBX3P40426 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBX3P40426 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBX3P40426 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBX3P40426 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PBX3P40426 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX3P40426 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX3P40426 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX3P40426 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX3P40426 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX3P40426 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX3P40426 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX3P40426 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX3P40426 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX3P40426 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX3P40426 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBX3P40426 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBX3P40426 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBX3P40426 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBX3P40426 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX3P40426 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX3P40426 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX3P40426 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX3P40426 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX3P40426 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX3P40426 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX3P40426 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX3P40426 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX3P40426 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX3P40426 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX3P40426 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX3P40426 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX3P40426 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX3P40426 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX3P40426 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX3P40426 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX3P40426 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX3P40426 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX3P40426 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX3P40426 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX3P40426 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX3P40426 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX3P40426 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX3P40426 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX3P40426 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX3P40426 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX3P40426 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX3P40426 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX3P40426 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX3P40426 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX3P40426 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX3P40426 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX3P40426 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX3P40426 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX3P40426 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX3P40426 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX3P40426 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX3P40426 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX3P40426 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX3P40426 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX3P40426 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX3P40426 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX3P40426 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX3P40426 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX3P40426 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX3P40426 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX3P40426 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX3P40426 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX3P40426 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms