Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms