Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHI3L1P36222 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHI3L1P36222 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms